Інкубаційний період триває від 2 до 14 днів. Зазвичай хвороба проявляється раптовим пригніченням тварини, підвищенням температури тіла до 40-41 ° С, блюванням і рідким випорожненням. Блювотні маси спочатку водянисто-жовті або коричнюваті, пізніше стають слизовими, часто з домішкою крові. Одночасно чи через короткий час розвивається пронос. Фекалії рідкі, смердючі, безбарвні, жовті з домішкою крові, іноді з пластівцями фібрину. Перелічені ознаки є наслідком катарального чи геморагічного запалення шлунка та кишечника.

У разі гострого перебігу хвороби стан тварини різко погіршується, її температура швидко підвищується до 40 °С і від. Кішки відмовляються від корму. Виникає блювання; блювотні маси мають зеленувато-жовтий колір, містять слиз, іноді кров. Сеча кішок стає темно-жовтою. Фекалії стають рідкими та смердючими, часто з домішкою крові та слизу. Вони містять значну кількість вірусів. Слизова оболонка ротової порожнини кішок стає сухою та синюшною.

У разі надгострої течії панлейкопенії відбувається раптова смерть кішки. При легкій течії кішки відчувають лише нездужання, а хвороба виявляється лише при дослідженні крові. Гостра форма захворювання протікає 1-10 днів. Хвороба дуже небезпечна: серед кошенят смертність сягає 90%. Кішки, що пережили перші 3-4 дні, зазвичай одужують, але залишаються носіями вірусу, тобто. виділяють вірус у зовнішнє середовище.